• A Budapest-Győr-Hegyeshalom vonalon közlekedő gyorsvonatok a Keleti pályaudvar helyett a Déli pályaudvarra érkeznek és onnét indulnak. A Déli pályaudvarról 13:50-kor, 14:50-kor, 15:50-kor, 17:50-kor Tatabányára, illetve 16:50-kor Komáromba induló vonatok Kelenföldről indulnak, valamint a Komáromból 6:40-kor induló és a Tatabányáról 15:11-kor induló vonat korábban, 14:59-kor fog indulni, illetve a Déli pályaudvar helyett Kelenföldig közlekedik.

• A Budapest-Székesfehérvár vonalon, a Déli pályaudvarról 8 óra után induló és érkező tárnoki elővárosi vonatok csak Kelenföldig járnak és onnan is indulnak.

• A Budapest-Pusztaszabolcs vonalon, a Százhalombattáról 6:39-kor induló vonat a Déli pályaudvar helyett csak Kelenföldig közlekedik.
• 
  A Budapest-Pusztaszabolcs-Pécs/Kaposvár-Zágráb vonal InterCity járatai és a bajai expressz vonatok, valamint a Rippl-Rónai nemzetközi vonat a Keleti pályaudvar helyett a Déli pályaudvarról indul, és oda érkezik.

• A Budapest-Hatvan vonal elővárosi vonatai módosított menetrend szerint közlekednek. A Gödöllő-Állami telepek megállóhelynél - a reggeli és esti időszak kivételével - csak a munkanapokon közlekedő Budapest-Hatvan (-Budapest) viszonylatú vonatok állnak meg.

• A Budapest-Újszász-Szolnok vonalon közlekedő egyes reggeli, illetve az összes délutáni nagykátai elővárosi vonat a Keleti pályaudvar helyett, a ferencvárosi vasútállomás érintésével Kelenföldre érkezik, és onnan indul.
• A Budapest-Kelebia-Budapest viszonylatban közlekedő személyvonatok a Keleti pályaudvar helyett Kőbánya-Kispestre érkeznek és onnan fordulnak.

• A felújítás a GYSEV Zrt. által közlekedtetett vonatokat is érinti: április 13-a és május 27-e között a Sopronból közvetlenül Budapestig közlekedő gyorsvonatok Budapest-Keleti pályaudvar helyett Budapest-Déli pályaudvarra érkeznek és onnan is indulnak. A gyorsvonatok Győr és Budapest-Déli pályaudvar között módosított menetrend alapján közlekednek. A vasúttársaság Sopronból és Szombathelyről indított Intercity járatai esetében ugyanakkor nem lesz változás: az Intercity vonatok Budapest-Keleti pályaudvarra érkeznek és onnan is indulnak vissza a két nyugat-dunántúli városba.

A kiindulási és célállomás változása mellett az utasoknak számolniuk kell azzal, hogy a vonatok összeállításában is változások lesznek a korszerű motorvonatok és a hagyományos, elővárosi ingavonatok közlekedtetése számos esetben felcserélődhet.

Azt egyelőre nem tudni, hogy a MÁV Start menetrendet megjelenítő mobiltelefonos applikációja követi-e a változásokat, és az okostelefonnal rendelkezők megbízhatnak a friss telefonos információkban.